Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms