Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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