Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna4O35343 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms