Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkd2O35245 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms