Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 670.5 ms