Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Nedd9O35177 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd9O35177 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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