Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Casq1O09165 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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