Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms