Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MttpO08601 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MttpO08601 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MttpO08601 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MttpO08601 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MttpO08601 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MttpO08601 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MttpO08601 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MttpO08601 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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