Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms