Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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