Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccer2J3QPU5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms