Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms