Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c2J3QNM1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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