Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms