Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms