Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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