Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
D430041D05RikF6ZGR6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D430041D05RikF6ZGR6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms