Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhox13F6YCR7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms