Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Crocc2F6XLV1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms