Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SmgcF6VRN1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms