Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6619F6URP1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms