Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm10477F6SW83 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm10477F6SW83 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm10477F6SW83 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm10477F6SW83 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm10477F6SW83 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm10477F6SW83 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm10477F6SW83 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm10477F6SW83 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10477F6SW83 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms