Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm340F6RGI3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms