Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms