Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms