Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc146E9Q9F7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc146E9Q9F7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms