Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r116E9Q6I0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r116E9Q6I0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms