Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Srsf11E9Q6E5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf11E9Q6E5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms