Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DspE9Q557 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms