Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms