Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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