Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430401F13RikE9Q328 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms