Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms