Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20425E9Q035 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms