Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms