Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54bE9PXC0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Srp54bE9PXC0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Srp54bE9PXC0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Srp54bE9PXC0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Srp54bE9PXC0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Srp54bE9PXC0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Srp54bE9PXC0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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