Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc144bE9PVZ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms