Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cngb1E1AZ71 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cngb1E1AZ71 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms