Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms