Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9630041A04RikD3Z3U4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms