Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms