Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SafbD3YXK2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms