Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms