Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5475D3YV11 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5475D3YV11 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms