Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm4950D3YUM8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm4950D3YUM8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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