Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd8B9EJ80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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