Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms