Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pnldc1B2RXZ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms