Protein–RNA interactions for Protein: B2RV46

Spata6l, Spermatogenesis associated 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6lB2RV46 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spata6lB2RV46 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spata6lB2RV46 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms